少女在濒死父亲遗物中发现一瓶星砂，倒出后整座小岛开始出现已灭绝的动物幻影。
琉球群岛一座即将被海平面淹没的小岛，少女琉唯的父亲是最后一代“星砂守夜人”。父亲病危时给她一瓶发光的星砂，说这是岛上所有记忆的结晶。琉唯无意中倒出星砂，已消失的琉球兔、渡鸦、儒艮的幻影接连出现，却同时加速岛屿沉没。她必须在三天内，将星砂放回海底神社，否则岛屿和幻影都会永远消失。途中她要对抗开发商、说服村民，最终明白：守住岛不是留住陆地，而是留住故事。
吉卜力风格的手绘动画，每一帧都想截图。星砂发光如萤火虫之海的画面美到窒息。环保主题不喊口号，用一个女孩的奔跑和眼泪就讲明白了。结尾父亲幻影挥手告别时，全场抽泣。
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